โรงเรียนวัดคงคาเลียบ  ก่อตั้งเมื่อวันที่  9  กรกฎาคม  2482  ตั้งอยู่หมู่ที่  1 ตำบลฉลอง  อำเภอสิชล  จังหวัดนครศรีธรรมราช  อาศัยที่ดินของโรงเรียนวัดคงคาเลียบ  ครั้งแรกเปิดสอนเป็นสาขาของโรงเรียนวัดกลาง  อาคารเรียนหลังแรกเป็นอาคารเรียนชั่วคราว ทางราชการส่งนายไสว    คงทิม  และนางสาวสวิง  คงศักดิ์  มาเป็นครู  เปิดสอนชั้นเตรียมถึงชั้นประถมศึกษาปีที่  1  ต่อมาเมื่อวันที่ 25 กรกฎาคม  2482  ได้อนุมัติให้เปิดเป็นโรงเรียนเอกเทศ  และให้ชื่อว่า “โรงเรียนประชาบาลตำบลฉลอง 4 วัดคงคาเลียบ”
พ.ศ.  2486  ทางราชการแต่งตั้งให้นายร้อย  หนูพรหม  มาเป็นครูใหญ่  โรงเรียนได้รับการพัฒนาขึ้นเป็นลำดับ
      ต่อมา  พ.ศ.  2517  นายร้อย  หนูพรหม  ครูใหญ่ได้ลาออกจากราชการจึงแต่งตั้งให้นายไสว  คงทิมมาเป็นครูใหญ่แทน
พ.ศ.  2520  นายไสว  คงทิม  ครูใหญ่เกษียณอายุราชการ  ทางราชการจึงแต่งตั้งให้นายประยูร  มีกลับ  มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ โรงเรียนได้ขยายชั้นเรียนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่  6
พ.ศ.  2528   นายประยูร  มีกลับ  (พิทักษ์พันธกุล)  ได้ถึงแก่กรรม  ทางราชการจึงแต่งตั้งให้นายนิคม  จันทร์หอม รักษาการในตำแหน่งครูใหญ่
     2  ตุลาคม  2533  นายสุภาพ  อิศระพันธุ์  ครูใหญ่ได้ลาออกจากราชการ  ทางราชการจึงแต่งตั้งให้นายสรรเสริญ  ครุยทอง  มาดำรงตำแหน่งแทน จน  1  พฤศจิกายน  2536  ได้ลาออกจากราชการ นายสุรพล  สุวรรณ์ รักษาการในตำแหน่งแทน
ต่อมาโรงเรียนได้ยกฐานะตำแหน่งครูใหญ่  เป็นตำแหน่งอาจารย์ใหญ่   และเมื่อวันที่             ๑  กุมภาพันธุ์  2537  ทางราชการได้แต่งตั้งนายประกอบ  ก๋งทอง  อาจารย์ใหญ่โรงเรียนวัดบ้านเนิน  สปอ.เชียรใหญ่มาดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่  และได้ย้ายมาสร้างอาคารเรียน แบบ สปช.105/29  ในที่ราชพัสดุ  เลขที่  นศ.382
     ต่อมาวันที่  1  พฤษภาคม  2549  นายประกอบ  ก๋งทอง  ได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดสวนศิขรบรรพต   อำเภอสิชล  และทางราชการได้แต่งตั้งให้ นายสุภรณ์    อิศระพันธุ์  ผู้อำนวยการโรงเรียนวัดคุ้งวังวัว  สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษานครศรีธรรมราช  เขต  2  มาดำรงตำแหน่งแทน    ต่อมานายสุภรณ์ อิศระพันธุ์ ได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดคุ้งวังวัว  สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานครศรีธรรมราช  เขต  2  และทางราชการได้แต่งตั้งให้  นายณรงค์ฤทธิ์  อินทรชู  มาดำรงตำแหน่งแทน
ต่อมานายณรงค์ฤทธิ์ อินทรชู ได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนคล้ายสอนศึกษา สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานนทบุรี เขต 2  นางศรีสุคล ก๋งทอง รักษาราชการใน ตำแหน่งแทน
     ต่อมาวันที่  27 ตุลาคม  2558 สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานครศรีธรรมราช เขต 4 ได้แต่งตั้ง นายกิตติศักดิ์ บุญชูช่วย ผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านโก้งโค้ง สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานครศรีธรรมราช เขต  3  มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดคงคาเลียบ ต่อมาวันที่ 12 ธันวาคม 2562 นายกิตติศักดิ์ บุญชูช่วย ได้ย้ายไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดจอมทอง สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานครศรีธรรมราช เขต 4 นางศรีสุคล ก๋งทอง รักษาการในตำแหน่งแทน
ต่อมาวันที่ 7 เมษายน 2563 ทางราชการได้แต่งตั้งให้ นางนุกูล เพ็ชร์แก้ว มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดคงคาเลียบ
ต่อมาวันที่ 9 พฤศจิกายน 2564 ทางราชการได้แต่งตั้งให้นายอภิจิตร์ ณ นคร มาดำรงตำแหน่งรักษาการในตำแหน่งผู้อำนวยการสถานศึกษา
      ต่อมาวันที่ 11 ตุลาคม 2566 ทางราชการสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษานครศรีธรรมราช เขต 4 ได้บรรจุแต่งตั้ง นายภราดร สุทธิผกาพัน มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดคงคาเลียบ จนถึงปัจจุบัน